私たちの研究室では遺伝子発現における翻訳のしくみやncRNAの機能などについて研究しています

研究業績

科学研究費補助金・競争的外部資金

7. 科学研究費・基盤B、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:翻訳停滞解消因子YaeJの生理的役割と反応機構の解明、期間:2021-2024年度

6. 公益財団法人 野田産業科学研究所 奨励研究助成、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:翻訳停滞解消因子ArfAを標的とする新規抗生物質の探索と作用機序の解明、期間:2021年度

5. 公益財団法人 日本化学研究会 化学研究連絡助成、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:ペプチド解離因子RF2による終止コドン非依存的翻訳終結の分子メカニズムの解明、2020年度

4. 上原記念生命科学財団 研究奨励金、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:翻訳停滞解消を阻害する薬剤の探索と作用機序の解明、期間:2019年度

3. 科学研究費・若手B、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:ArfAによる翻訳停滞解消メカニズムの解明、期間:2016-2018年度

2. 科学研究費・若手B、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:大腸菌トランス・トランスレーションの分子メカニズムの解明、期間:2011-2014年度

1. 科学研究費・若手スタートアップ、栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:トランス翻訳の分子メカニズムの解明、期間:2009-2010年度


学術論文・著書  (IFは2020年)

29. Hoshino S, Kanemura R, Kurita D, Soutome Y, Himeno H, Takaine M, Watanabe M, Nameki N. A stalled-ribosome rescue factor Pth3 is required for mitochondrial translation against antibiotics in Saccharomyces cerevisiae. Communications Biology, 4, 300, 2021 (Impact Factor = 6.268)

28. Muto A, Goto S, Kurita D, Ushida C, Himeno H. Involvement of GcvB small RNA in intrinsic resistance to multiple aminoglycoside antibiotics in Escherichia coli. Journal of Biochemistry, mvaa122, 2020 (Impact Factor = 3.387)

27. Kurita D**(**Corresponding author), Abo T, Himeno H**. Molecular determinants of Release Factor 2 for ArfA-mediated ribosome rescue. Journal of Biological Chemistry, 295, 13326-13337, 2020 (Impact Factor = 5.157)

26. López-Alonso JP, Kaminishi T, Kikuchi T, Hirata Y, Iturrioz I, Dhimole N, Schedlbauer A, Hase Y, Goto S, Kurita D, Muto A, Zhou S, Naoe C, Mills DJ, Gil-Carton D, Takemoto C, Himeno H, Fucini P, Connell SR. RsgA couples the maturation state of the 30S ribosomal decoding center to activation of its GTPase pocket. Nucleic Acids Research. 45, 6945-6959, 2017 (Impact Factor = 16.971)

25. Ma C*, Kurita D*(*Co-first author), Li N, Chen Y, Himeno H, Gao N. Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2. Nature, 541, 550-553, 2017 (Impact Factor = 49.962)

24. 姫野俵太、栗田大輔 細菌におけるリボソームレスキュー機構、化学と生物, 日本農芸化学会, 878-884, 2016

23. Himeno H, Nameki N, Kurita D, Muto A, Abo T. Ribosome rescue systems in bacteria. Biochimie. 114, 102-112, 2015 (Impact Factor = 4.079)

22. Kurita D**(**Corresponding author), Chadani Y, Muto A, Abo T, Himeno H. ArfA recognizes the lack of mRNA in the mRNA channel after RF2 binding for ribosome rescue. Nucleic Acids Research. 42, 13339-13352, 2014 (Impact Factor = 16.971)

21.Kurita D*(*Co-first author), Miller M*, Muto A, Buskirk A, Himeno H. Rejection of tmRNA• SmpB after GTP hydrolysis by EF-Tu on ribosomes stalled on intact mRNA. RNA, 20, 1706-1714, 2014 (Impact Factor = 4.942)

20. Himeno H, Kurita D, Muto A. tmRNA-mediated trans-translation as the major ribosome rescue system in a bacterial cell. Frontiers in Genetics. 5, 66, 2014 (Impact Factor = 4.599)

19. Himeno H, Kurita D, Muto A. Mechanism of trans-translation revealed by in vitro studies. Frontiers in Microbiology. 5, 65, 2014 (Impact Factor = 5.640)

18. 姫野俵太、栗田大輔、武藤昱 2つの機能を有するtmRNAによる細菌の翻訳停滞解消システム、実験医学、31巻・7号、54-60、2013

17. Kurita D, Muto A, Himeno H. In vitro trans-translation assays. Methods in Molecular Biology, 905, 311-325, 2012

16. Kurita D, Muto A, Himeno H. tRNA/mRNA mimicry by tmRNA and SmpB in trans-translation. Journal of Nucleic Acids, Article ID 130581, doi:10.4061/2011/130581. 2011

15. Himeno H, Kurita D, Muto, A.: Trans-translation by tmRNA and SmpB: a bacterial quality control system of translation. Advances in Genetics Research, Kevin V. Urabano Ed., 6, 161-203, (Chapter3), Nova Science Publishers Inc., 2010

14. 姫野俵太、栗田大輔、武藤昱 2つのtRNA/mRNAハイブリッド –トランス・トランスレーション- mRNAプログラム 多様性と非対称性の獲得戦略(稲田利文、大野睦人編)、共立出版、2201-2206. 2009

13. Kurita D, Muto A, Himeno H. Role of the C-terminal tail of SmpB in the early stage of trans-translation. RNA. 5, 980-990. 2010 (Impact Factor = 4.942)

12. Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H. Trans-translation by tmRNA and SmpB. Nucleic Acids Symp Ser. 53, 305-306. 2009

11. 姫野俵太、栗田大輔、武藤昱 2つのtRNA/mRNAハイブリッド –トランス・トランスレーション- 蛋白質核酸酵素、共立出版、2201-2206. 2009

10. Himeno H, Kurita D, Muto A. Trans-translation by tmRNA and a protein mimicking tRNA and mRNA. In Toma E. Esterhouse & Lado B. Petrinos Eds., Protein Biosynthesis, pp69-107, Nova Science Publishers Inc (2009.0330) (ISBN: 978-1-60692-156-2)

9. 栗田大輔、武藤昱、姫野俵太. mRNAを擬態するタンパク質. 化学と生物、日本農芸化学会 465-471. 2008

8. Kurita D, Sasaki R, Muto A, Himeno H. Interaction of SmpB with ribosome from directed hydroxyl radical probing. Nucleic Acids Res. 21, 7248-55. 2007 (Impact Factor = 16.971)

7. Kurita D, Konno T, Takada K, Muto A, Himeno H. Molecular mechanism of trans-translation. Nucleic Acids Symp Ser. 51, 43-4. 2007

6. Konno T, Kurita D, Takada K, Muto A, Himeno H. A functional interaction of SmpB with tmRNA for determination of the resuming point of trans-translation. RNA. 10, 1723-31. 2007 (Impact Factor = 4.942)

5. 姫野俵太、栗田大輔、高田一馬、今野貴之、塙(末次)京子、竹本千重、川添将仁、横山茂之、行木信一、河合剛太、武藤昱. トランス・トランスレーションの分子メカニズム. 生化学、 日本生化学会 79, 213-21. 2007

4. Asano K, Kurita D, Takada K, Konno T, Muto A, Himeno H. Competition between trans-translation and termination or elongation of translation. Nucleic Acids Res. 17, 5544-52. 2005 (Impact Factor = 16.971)

3. Takada K, Takemoto C, Kawazoe M, Konno T, Matsuta N, Kurita D, Asano K, Shirouzu M, Yokoyama S, Muto A, Himeno H. Functional analysis of factors involved in trans-translation. Nucleic Acids Symp Ser. 49, 101-2. 2005

2. Konno T, Kurita D, Takahashi T, Muto A, Himeno H. Initiation-shift of trans-translation by aminoglycosides. Nucleic Acids Symp Ser. 48, 299-300. 2004

1. Konno T, Takahashi T, Kurita D, Muto A, Himeno H. A minimum structure of aminoglycosides that causes an initiation shift of trans-translation. Nucleic Acids Res. 14, 4119-26. 2004 (Impact Factor = 16.971)