私たちの研究室では遺伝子発現における翻訳のしくみやncRNAの機能などについて研究しています

研究業績

科学研究費補助金・競争的外部資金

  • 科学研究費・若手B 栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:ArfAによる翻訳停滞解消メカニズムの解明、期間:2016-2018年度

 

  • 科学研究費・若手B 栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:大腸菌トランス・トランスレーションの分子メカニズムの解明、期間:2011-2014年度

 

  • 科学研究費・若手スタートアップ 栗田大輔(研究代表者)、研究課題名:トランス翻訳の分子メカニズムの解明、期間:2009-2010年度

 

学術論文・著書

  • 26. López-Alonso JP, Kaminishi T, Kikuchi T, Hirata Y, Iturrioz I, Dhimole N, Schedlbauer A, Hase Y, Goto S, Kurita D, Muto A, Zhou S, Naoe C, Mills DJ, Gil-Carton D, Takemoto C, Himeno H, Fucini P, Connell SR. RsgA couples the maturation state of the 30S ribosomal decoding center to activation of its GTPase pocket. Nucleic Acids Research. 45, 6945-6959, 2017

 

  • 25. Ma C*, Kurita D*, Li N, Chen Y, Himeno H, Gao N. Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2. Nature, 541, 550-553, 2017 *These authors contributed equally to this work

 

  • 24. 姫野俵太、栗田大輔 細菌におけるリボソームレスキュー機構、化学と生物, 日本農芸化学会, 878-884, 2016

 

  • 23. Himeno H, Nameki N, Kurita D, Muto A, Abo T. Ribosome rescue systems in bacteria. Biochimie. 114, 102-112, 2015

 

  • 22. Kurita D, Chadani Y, Muto A, Abo T, Himeno H. ArfA recognizes the lack of mRNA in the mRNA channel after RF2 binding for ribosome rescue. Nucleic Acids Research. 42, 13339-13352, 2014

 

  • 21. Kurita D*, Miller M*, Muto A, Buskirk A, Himeno H. Rejection of tmRNA• SmpB after GTP hydrolysis by EF-Tu on ribosomes stalled on intact mRNA. RNA, 20, 1706-1714, 2014(査読有)*These authors contributed equally to this work

 

  • 20. Himeno H, Kurita D, Muto A. tmRNA-mediated trans-translation as the major ribosome rescue system in a bacterial cell. Frontiers in Genetics. 5, 66, 2014

 

  • 19. Himeno H, Kurita D, Muto A. Mechanism of trans-translation revealed by in vitro studies. Frontiers in Microbiology. 5, 65, 2014

 

  • 18. 姫野俵太、栗田大輔、武藤昱 2つの機能を有するtmRNAによる細菌の翻訳停滞解消システム、実験医学、31巻・7号、54-60、2013

 

  • 17. Kurita D, Muto A, Himeno H. In vitro trans-translation assays. Methods in Molecular Biology, 905, 311-325, 2012

 

  • 16. Kurita D, Muto A, Himeno H. tRNA/mRNA mimicry by tmRNA and SmpB in trans-translation. Journal of Nucleic Acids, Article ID 130581, doi:10.4061/2011/130581. 2011

 

  • 15. Himeno H, Kurita D, Muto, A.: Trans-translation by tmRNA and SmpB: a bacterial quality control system of translation. Advances in Genetics Research, Kevin V. Urabano Ed., 6, 161-203, (Chapter3), Nova Science Publishers Inc., 2010

 

  • 14. 姫野俵太、栗田大輔、武藤昱 2つのtRNA/mRNAハイブリッド –トランス・トランスレーション- mRNAプログラム 多様性と非対称性の獲得戦略(稲田利文、大野睦人編)、共立出版、2201-2206. 2009

 

  • 13. Kurita D, Muto A, Himeno H. Role of the C-terminal tail of SmpB in the early stage of trans-translation. RNA. 5, 980-990. 2010

 

  • 12. Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H. Trans-translation by tmRNA and SmpB. Nucleic Acids Symp Ser. 53, 305-306. 2009

 

  • 11. 姫野俵太、栗田大輔、武藤昱 2つのtRNA/mRNAハイブリッド –トランス・トランスレーション- 蛋白質核酸酵素、共立出版、2201-2206. 2009

 

  • 10. Himeno H, Kurita D, Muto A. Trans-translation by tmRNA and a protein mimicking tRNA and mRNA. In Toma E. Esterhouse & Lado B. Petrinos Eds., Protein Biosynthesis, pp69-107, Nova Science Publishers Inc (2009.0330) (ISBN: 978-1-60692-156-2)

 

  • 9. 栗田大輔、武藤昱、姫野俵太. mRNAを擬態するタンパク質. 化学と生物、日本農芸化学会 465-471. 2008

 

  • 8. Kurita D, Sasaki R, Muto A, Himeno H. Interaction of SmpB with ribosome from directed hydroxyl radical probing. Nucleic Acids Res. 21, 7248-55. 2007

 

  • 7. Kurita D, Konno T, Takada K, Muto A, Himeno H. Molecular mechanism of trans-translation. Nucleic Acids Symp Ser. 51, 43-4. 2007

 

  • 6. Konno T, Kurita D, Takada K, Muto A, Himeno H. A functional interaction of SmpB with tmRNA for determination of the resuming point of trans-translation. RNA. 10, 1723-31. 2007

 

  • 5. 姫野俵太、栗田大輔、高田一馬、今野貴之、塙(末次)京子、竹本千重、川添将仁、横山茂之、行木信一、河合剛太、武藤昱. トランス・トランスレーションの分子メカニズム. 生化学、 日本生化学会 79, 213-21. 2007

 

  • 4. Asano K, Kurita D, Takada K, Konno T, Muto A, Himeno H. Competition between trans-translation and termination or elongation of translation. Nucleic Acids Res. 17, 5544-52. 2005

 

  • 3. Takada K, Takemoto C, Kawazoe M, Konno T, Matsuta N, Kurita D, Asano K, Shirouzu M, Yokoyama S, Muto A, Himeno H. Functional analysis of factors involved in trans-translation. Nucleic Acids Symp Ser. 49, 101-2. 2005

 

  • 2. Konno T, Kurita D, Takahashi T, Muto A, Himeno H. Initiation-shift of trans-translation by aminoglycosides. Nucleic Acids Symp Ser. 48, 299-300. 2004

 

  • 1. Konno T, Takahashi T, Kurita D, Muto A, Himeno H. A minimum structure of aminoglycosides that causes an initiation shift of trans-translation. Nucleic Acids Res. 14, 4119-26. 2004